روش لاگون در تصفیه فاضلاب از عناصر طبیعی مانند آفتاب، جلبک ها، اکسیژن و باکتری ها برای تصفیه فاضلاب استفاده می کند. جریان ورودی وارد حوضچه شده و با عبوری کند از حوضچه فرآیند لاگون در تصفیه فاضلاب آلودگی ها ته نشین و باکتری ها به تجزیه مواد آلی می پردازند.